Navaleno se encuentra ubicado en la comarca soriana de Pinares. Con una altura de 1.105 metros sobre el nivel del mar, el término municipal abarca una superficie de 2.521 hectáreas. Su situación se enclava en una zona de transición entre los relieves abruptos de las sierras del noroeste del Sistema Ibérico como son Neila, Urbión y Cebollera, y las llanuras centrales de Duero. Su pasado carretero todavía puede observarse en las viejas casas de piedra del Barrio de Triana.